- MorphMesh
- MorphMesh ist ein Skript für das Modelling-Programm blender. Mit MorphMesh können Konturen von verschiedenen Schnittebenen zu einem Surface-Modell verbunden werden. MorphMesh arbeitet mit gewichteten Parametern, so dass auch bei schwierigen Konturverläufen gute Ergebnisse erreicht werden.
- Autokontrast
- Autokontrast ist ein Perl-Skript zum Umwandeln von Ditabis-ImagePlate-Bildern in PGM- oder TIF-Dateien. Mit Autokontrast kann die Bit-Tiefe und der Kontrast der Bilder eingestellt werden. Autokontrast bietet zusätzlich die Möglichkeit, Metainformationen in Ditabis und PGM Dateien zu bearbeiten.
- AnalySIS Makros
- Das kommerzielle Programm AnalySIS von Soft Imaging Systems wird von uns für die Aquisition von Bildern an Licht- und Elektronenmikroskopen genutzt, sowie für die Archivierung der Bilder in Datenbanken. Wir haben verschiedene Makros geschrieben, die die Arbeit mit AnalySIS erleichtern.
- Adobe Photoshop Skripte
- Adobe Photoshop ist ein verbreitetes,
umfangreiches Bilbearbeitungsprogramm, das auch für die wissenschaftliche
Bildverarbeitung gut geeignet ist. Durch eine Javascript-Schnittstelle
kann Photoshop erweitert werden. Wir haben einige Skripte erstellt, die insbesondere die Arbeit
mit Bildstapeln für 3D-Rekonstruktionen erleichtern sollen.
- ImageJ Makros
- ImageJ bietet zahlreiche Funktionen für die Arbeit mit medizinischen und biologischen Bildstapeln. ImageJ basiert auf Java und wird von zahlreichen Institutionen weiterentwickelt und erweitert. Wir haben zwei Makros geschrieben, die eine rotierende Projektion oder Tiefencodierung erzeugen.
- Imodalign
- Imodalign ist ein graphisches User-Interface (GUI) für die Alignment-Programme aus dem Imod Software Package. Mit Imodalign können Bildstapel in Graustufen oder RGB mit mehreren Gigabyte Größe aligniert werden. Dazu wird zuerst ein automatisches Alignment durchgeführt, das dann von Hand korrigiert werden kann.
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